На клубнях заболевание проявляется вначале в виде поверхностных коричневых пятен неправильной формы с темным окаймлением. Текстура пораженных тканей под пятнами упругая, резиноподобная. Если такой клубень разрезать, то через 15-20 минут инфицированная ткань розовеет, а затем становится серо-бурой, до черной. Иногда цвет тканей не изменяется. При повышенной температуре и влажности воздуха на срезах и поверхности больных клубней через 1-2 дня образуется налет мицелия с обильным спороношением. Из пораженных тканей выделяется коричневый эксудат со специфическим запахом. В дальнейшем они ослизняются. Клубни становятся водянистыми, кожура легко отслаивается. В условиях низкой температуры и влажности больные клубни мумифицируются.

В условиях повышенной влажности из-за сильного разложения пораженных тканей резиновую гниль часто относят к мокрым бактериальным гнилям. В сухих условиях, наоборот, признаки заболевания приобретают сходство с сухой фузариозной гнилью или удушьем.

На ростках картофеля до всходов появляются участки побуревшей ткани. Она становится рыхлой, мокрой, иногда на ней можно наблюдать слабое спороношение возбудителя болезни. Такие ростки легко ломаются в местах поражения или сгнивают полностью. Инфекция проникает в меристематические ткани, и образование новых ростков становится невозможным.